IIRC, o MMC do IIS é codificado para sempre solicitar o modelo com o nome "webserver". Seu modelo personalizado não tem esse nome, acho que reutilizar esse nome para um modelo personalizado nem é possível. Depois de removê-lo, o erro "não encontrado" é relatado incorretamente como "acesso negado".
Para usar seu modelo personalizado, você precisará usar a interface do navegador para a CA e selecionar seu modelo lá.