Na página de manual , tente:
pkg query -e '%a = 1' %o
Você pode fazer um pkg set -A ... para definir o sinalizador automático, mas como você faz um pkg query para todos os pacotes com esse sinalizador automático definido? Eu vejo que você pode fazer pkg query -e '%#r != 0' , mas isso certamente não é o mesmo.
Na página de manual , tente:
pkg query -e '%a = 1' %o
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