Com o DFS integrado ao domínio (que você tem), seus controladores de domínio já cuidam disso. Contanto que você tenha controladores de domínio em ambos os sites e seus sites e sub-redes de AD configurados corretamente, você está pronto para começar. Seus clientes simplesmente perguntam ao CD mais próximo pelos caminhos necessários.
Basta apontar seus clientes para
\<domain.fqdn>\<DFS name>