Sim. Você precisa instalar uma ferramenta chamada xwinwrap, então você pode executar qualquer protetor de tela como um plano de fundo como este: xwinwrap -ni -argb -fs -s -st -sp -nf -b - /usr/lib/xreensaver/glmatrix -window-id WID
Notas: Você pode ter que parar nautilus assumindo o seu desktop. Você pode definir isso na ferramenta gnome tweak em 'Desktop'. É um recurso muito pesado com alguns protetores de tela.