Hm, que tal atualizar para um sistema atual, de preferência de 64 bits? Então você pode executar tudo isso em 3 máquinas virtuais em um servidor de baixo final, praticamente.
Você pode reiniciar o IIS apenas forçando uma linha de comando iisreset, mas acho que você pode ter que começar a procurar a causa raiz - algum erro em algum lugar. Não ajuda que você use uma tecnologia que não é 4 generatiosn para trás, IIS sábio (7,0, 7,5, 8,0), então você está praticamente sozinho e com suporte pago pela MS; (