Suponho que você quer dizer que seu usuário administrador não é o usuário root certo? Certifique-se de que você está gerenciando as preferências do usuário e não as preferências do computador.
Eu corri um laboratório educacional de 20 iMacs, todos executando o Mac OS 10.7.5 (11G63) com o ARD versão 3.6.2. Meu servidor e todos os iMacs executam o Lion. Eu pareço ter cruzado algo e agora meu usuário root está sendo controlado com as mesmas preferências que eu configurei para meus usuários LDap. De alguma forma, a ARD assumiu o controle do usuário root, principalmente as Preferências do Sistema. Existe uma maneira de contornar este problema. Eu preciso root para ter permissões completas (como deveria), enquanto ainda controlando os usuários individuais que fazem logon.
Suponho que você quer dizer que seu usuário administrador não é o usuário root certo? Certifique-se de que você está gerenciando as preferências do usuário e não as preferências do computador.