A linha problemática é:
CustomLog /usr/local/apache/domlogs/newdomain.co.uk combined
O Apache não está reconhecendo combined
como um apelido de formato de log válido. Os apelidos vêm de diretivas LogFormat
anteriores; você terá que encontrar o correto e garantir que sua configuração seja carregada depois que ela ocorrer. Se isso não ocorrer ou você não quiser fazer isso, use a string de formato pretendida em vez do apelido.