Vendo que o seu pedido é enviado para o PHP, presumo que o seguinte bloco de localização não corresponda ao seu pedido, embora essa seja a sua intenção.
location ~ ^/admin/modules/([^/]+).*\.html|js|json|css|png|jpg|jpeg|gif|ico|pdf|zip|rar|air))$ {
there is no syntax for NOT matching a regular expression. Instead, match the target regular expression and assign an empty block, then use location / to match anything else.
Qual é a sua intenção com a parte ([^/]+)
nesse bloco de localização? Eu acho que você pode conseguir o que quer simplesmente removendo essa parte.
location ~ ^/admin/modules/.*\.html|js|json|css|png|jpg|jpeg|gif|ico|pdf|zip|rar|air))$ {