Usando o GNU screen é sua melhor aposta.
Tela inicial em execução quando você faz login pela primeira vez - executo screen -D -R , executo seu comando e ou a desconecto ou suspendo com CTRL-Z e, em seguida, desconecto da tela pressionando CTRL-A , em seguida D .
Quando você fizer login na máquina novamente, reconecte-o executando screen -D -R . Você estará no mesmo shell de antes. Você pode executar jobs para ver o processo suspenso, se você o fez, e executar %1 (ou o respectivo trabalho #) para forçá-lo novamente.