As vantagens de usar .tar.gz em vez de .gz são
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tararmazena mais metadados (permissões do UNIX, etc.) do quegzip. - a configuração pode ser expandida com mais facilidade para armazenar vários arquivos
- Os arquivos .tar.gz são muito comuns, arquivos somente-gzipados podem confundir alguns usuários. (cf. comentário de MelBurslans )
A sobrecarga de usar tar também é muito pequena.
Se não for realmente necessário, ainda não recomendo tar um único arquivo.
Existem muitas ferramentas úteis que podem acessar diretamente arquivos compactados (como zcat , zgrep etc. - também existente para bzip2 e xz ).