Em vi do
:1,$d
para excluir todas as linhas.
O : introduz um comando (e move o cursor para a parte inferior).
O 1,$ é uma indicação de quais linhas o comando a seguir ( d ) deve funcionar. Nesse caso, o intervalo da linha um até a última linha (indicado por $ , para que você não precise saber o número de linhas no documento).
O% final d significa excluir as linhas indicadas.
Existe um formulário mais curto ( :%d ), mas me vejo nunca usando. O :1,$d pode ser mais facilmente "adaptado" a, e. :4,$-2d deixando apenas as primeiras 3 e as últimas 2 linhas, excluindo o restante.