ffmpeg \
-i input1.mp4 \
-i input2.mp4 \
-filter_complex '[0:v]pad=iw*2:ih[int];[int][1:v]overlay=W/2:0[vid]' \
-map [vid] \
-c:v libx264 \
-crf 23 \
-preset veryfast \
output.mp4
Isso basicamente dobra o tamanho de input1.mp4 preenchendo o lado direito com preto do mesmo tamanho do vídeo original e, em seguida, coloca input2.mp4 sobre a parte superior da área preta com o filtro de sobreposição.
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