Você pode executar o comando a cada login ou pode colocá-lo na configuração do X.org assim:
Section "InputDevice"
Identifier "Logitech USB-PS/2 Optical Mouse"
Driver "evdev"
Option "Device" "/dev/input/by-id/usb-Logitech_USB-PS_2_Optical_Mouse-event-mouse"
Option "ButtonMapping" "12 1 0 3 4 5 6 7"
EndSection
Eu não sei os identificadores e as opções de driver do seu dispositivo, mas você recebe aqueles com xinput
e farejando em /dev/input
.