Esse diretório pode ser criado por qualquer aplicativo que siga o padrão de usuários do Freedesktop . Isso potencialmente inclui todos os aplicativos do Gnome ou do KDE.
Se você quiser saber qual aplicativo cria o arquivo, você pode usar o sistema de arquivos LoggedFS ou o Linux subsistema de auditoria . Veja É possível descobrir qual programa ou script criou um determinado arquivo? para mais informações.