Este é o mais próximo que você pode obter do que deseja, caso contrário, procure outro gerenciador de arquivos:
Procure por "Preferências", na guia "Visualizações", selecione "Visualizar novas pastas usando: exibição de lista " e, em seguida, selecione a guia "Exibição", haverá uma caixa de seleção informando 'Navegue pelas pastas em uma árvore', feche o Nautilus. Agora abra uma pasta e selecione a visualização de lista, assim você terá um comportamento semelhante a uma árvore no painel principal.
Se você não gosta de como é mostrado, tente outro gerenciador de arquivos.