Atualmente, não é possível configurar diretamente argumentos de duplicidade personalizados no deja-dup. Há uma solicitação de recurso informada, embora discuta esse problema.
Como solução, o que você pode fazer é alterar os valores de duplicidade global padrão no seguinte arquivo
sudo vim /usr/share/pyshared/duplicity/globals.py
As duas opções que você provavelmente deseja aumentar para superar seu problema de tempo limite são as seguintes
# network timeout value
timeout = 30
# number of retries on network operations
num_retries = 5
Por favor, note que esses valores serão sobrescritos sempre que houver uma nova versão de duplicidade instalada.