Opção 1: mover o diretório inicial
A melhor opção é copiar o seu diretório home para a outra unidade e montá-lo como /home
como Takkat descrito em seu comentário / resposta . Eu uso uma configuração como esta no meu laptop com um SSD e um disco rígido rápido de 7200rpm. Não notei qualquer degradação de desempenho durante a inicialização / login em comparação a ter /home
no SSD.
Opção 2: redirecionar diretórios específicos
Outra opção foi discutida aqui: Como eu integro meu sistema de arquivos do Windows ao Ubuntu? Observe que pastas especiais podem e devem ser redirecionadas por não usar links simbólicos. Para pastas regulares, você precisa saber onde os dados estão armazenados para substituir as pastas por um link simbólico, embora alguns aplicativos armazenem dados em diferentes diretórios:
$ find -iname vlc
./.local/share/vlc
./.cache/vlc
./.config/vlc
É possível que isso seja difícil em alguns aplicativos ou, no caso de uma migração ou reinstalação, você provavelmente acidentalmente exclua os dados que deseja manter. Portanto, vá com a opção 1.