Você precisa consertar o bootloader do Windows. Assim, inicie o disco de instalação do Windows e clique na opção Reparar o seu computador na inicialização.
Depois disso, clique na opção comando-prompt . Nesse prompt de comando, execute os seguintes comandos para corrigir o bootloader do Windows,
bootrec /fixmbr
bootrec /fixboot
bootrec /rebuildbcd
E, em seguida, tente boot-repair .