Não sei por que você gostaria, mas
software-center
deve fazer isso. Se você quiser usar a linha de comando para instalar um pacote, a maneira correta de fazê-lo seria
sudo apt-get install package-name
ou
sudo apt-get remove package-name
para removê-lo. Se você quer um gerenciador de pacotes baseado em texto, então você pode dar uma olhada no aptitude:
sudo aptitude