ntop é provavelmente sua melhor solução para fazer isso. Ele é projetado para funcionar a longo prazo e capturar exatamente o que você está procurando.
Ele pode mostrar a você quais destinos remotos estão sendo usados mais, quanto tráfego enviado para / de quais protocolos e portas estavam sendo usados, etc. Ele pode fazer o mesmo para os hosts de origem se você executá-lo em um roteador para ver as mesmas estatísticas em clientes locais também.
Em seguida, ele usa uma GUI da web para navegar e exibir essas informações.