Talvez você possa experimentá-lo na linha de comando com
find
Tem muitas opções. Veja a página man do manual do Ubuntu .
Por exemplo, todos os arquivos no meu diretório atual contendo as letras 'auth'
find /home/frank -name '*auth*'
Não é baseado em GUI, mas tem mais opções do que qualquer gerenciador de arquivos baseado em GUI. (Talvez Midnightcommander também possa fazer isso.)
grep
também é uma possibilidade.
Por exemplo, para encontrar a string 'AskUbuntu' em todos os arquivos do meu diretório pessoal:
grep -r "AskUbuntu" /home/frank
Veja a página man do grep nos Manuais do Ubuntu