Você pode associar facilmente os arquivos .py
ao IDLE. Você precisa clicar com o botão direito do mouse em um script python, escolher "Abrir com - > Outro aplicativo" e escolher IDLE na lista com a caixa de seleção perguntando se deve ser o aplicativo padrão marcado. Eu uso o XFCE, mas o Nautilus do Gnome deve ser similar.
Como alternativa, existe um arquivo de configuração em seu diretório pessoal que contém a lista de aplicativos padrão. Você pode acessá-lo no seguinte caminho:
~/.local/share/applications/mimeapps.list
Você pode estendê-lo com a seguinte linha:
text/x-python=idle.desktop
em que idle.desktop
representa o arquivo da área de trabalho da versão IDLE que você gostaria de usar, por exemplo, idle-python2.7.desktop
ou idle-python3.desktop
com base na versão do Python que você precisa usar.
NOTA:
Esteja ciente das permissões dos seus scripts. Se tiver a permissão executável, apesar do aplicativo padrão, seu sistema não abrirá em IDLE, pois tentará executá-lo.