Remmina tem isso configurável nas 'Preferências' - > guia 'teclado' - > Campo 'Grab keyboard'. Na minha instalação do Ubuntu esta é a tecla direita Ctrl .
Funciona para mim e parece se comportar como uma chave de alternância. Pressioná-lo novamente faz com que as teclas modificadoras funcionem na máquina local novamente.