Se o conteúdo desses arquivos for chamado de file1 , file2 e file3 em ordem de aparecimento, você poderá fazê-lo com o seguinte one-liner:
# python -c "x=open('file1').read(); y=open('file2').read(); print x in y or y in x"
True
# python -c "x=open('file2').read(); y=open('file1').read(); print x in y or y in x"
True
# python -c "x=open('file1').read(); y=open('file3').read(); print x in y or y in x"
False