Há pouca relação entre /proc/sys e /sys além do fato de que ambos são interfaces de kernel e uma coincidência de nomes.
/proc/sys é uma interface para sysctl , que são parâmetros de configuração do kernel. Ler ou modificar /proc/sys/foo/bar é equivalente a obter ou definir o foo.bar sysctl. Os valores de Sysctl são organizados por categorias semânticas, eles não estão intrinsecamente relacionados à estrutura do kernel. Muitos valores de sysctl são configurações presentes em todos os sistemas Linux, independentemente de quais drivers ou recursos são compilados; alguns estão relacionados a recursos opcionais (por exemplo, determinados protocolos de rede), mas nunca a dispositivos de hardware específicos.
/sys/module é, como o nome indica, uma interface para os módulos do kernel. Cada diretório corresponde a um módulo do kernel. Você pode ler e, às vezes, modificar os parâmetros do módulo foo escrevendo para /sys/module/foo/parameters/* .
Componentes que são carregados no kernel lêem seus parâmetros a partir da linha de comando do kernel. Esses parâmetros não podem ser definidos no tempo de execução (pelo menos não através de uma interface gerada automaticamente como /sys/module : o componente pode expor uma interface personalizada para isso).