Também sofri falhas graves ao ter uma boa quantidade de atividade de disco na VM e no sistema "nativo". O sistema era estável a rochas quando não estava usando uma VM, mesmo sob cargas pesadas. Eu tentei novas versões de kernel e novas versões do VirtualBox, mas o problema persistiu. Então eu mudei para um novo computador (um i7), que não teve o mesmo problema. No entanto, o computador com os problemas piorou e começou a travar em outras situações também. Agora ele nem sequer inicializa, mas congela enquanto está no estágio de BIOS do processo de inicialização. Pode ser um problema de hardware e / ou problemas com as instruções da VM na CPU.
Você pode tentar limitar o IO e / ou o número de CPUs usadas na VM e ver se isso ajuda.