[lib]poppler ganhou recentemente suporte para as anotações definidas nas especificações mais recentes do Adobe PDF, e isso foi implementado em evince . Infelizmente, ainda faltam alguns recursos, como a capacidade de excluir anotações (IIRC, isso é devido à falta de suporte de poppler , não evince ), e eu tive alguns problemas em editar comentários já existentes (mas eu não não tem tempo para depurar estes corretamente).
Portanto, por um lado, evince tem, através de poppler , suporte para anotações padrão incorporadas em PDF, o OTOH disse que o suporte não é (ainda) perfeito.
Isso também deve significar que outras ferramentas que usam poppler podem receber esse tipo de recurso em um futuro próximo.
Uma coisa que você pode achar irritante é a falta de um recurso de "salvar". Isso me deixa louco, tendo que usar "Salvar como" cada vez que eu quero salvar uma cópia das anotações (eu usei o Windows (não-NT) há alguns anos atrás, então eu ainda tenho, de vez em quando, isso strong desejo de salvar meu trabalho com frequência) - mas, de qualquer maneira, o evince é um visualizador, não um editor, então impingir "Salvar como" é realmente a maneira de encaixar isso na metáfora da interface.
Sobre a portabilidade, dependendo de onde você for, talvez seja suficiente se a ferramenta permitir que você pegue a "camada de anotação". Lembro-me de percorrer uma ferramenta de anotação em camadas para postscript há muitos anos (e naquela época já era um código antigo, que precisaria de algum trabalho para construir) - se eu tiver tempo e me encontrar precisando de ferramentas de anotação PDF / postscript novamente Eu posso ir cuidar disso para que eu possa cortá-lo ...