Seu shell local (provavelmente o bash) está se expandindo
user@host:/home/user/something/{file1,folder1,folder2,folder3,folder4}
para:
user@host:/home/user/something/file1 user@host:/home/user/something/folder1 user@host:/home/user/something/folder2 user@host:/home/user/something/folder3 user@host:/home/user/something/folder4
Em vez disso, você pode fazer:
scp -r -P PORT user@host:"/home/user/something/file1 /home/user/something/folder1 /home/user/something/folder2 /home/user/something/folder3 /home/user/something/folder4" folder/folder2/
ou, se você sabe que o shell de login do usuário no terminal remoto é bash, também é possível usar a expansão de chaves:
scp -r -P PORT user@host:"/home/user/something/{file1,folder1,folder2,folder3,folder4}" folder/folder2/
para que o shell remoto divida a string em argumentos em vez do shell local.