como você só usa o disco rígido secundário para backup, eu sugiro que o fstab não monte a unidade automaticamente e faça um script de backup que monte a unidade, faça o backup e desmonte a unidade novamente.
exemplo da linha fstab com a opção noauto:
/dev/sdb1 /media/backup ext4 user,noauto 0 0
O script bash para o backup seria iniciado com mount /media/backup
e terminado com umount /media/backup