O MATE usa sua própria versão do gerenciador de janelas do Gnome 2 Metacity, se bem me lembro naquela época, não foi por isso que os usuários preferiram usar o Compiz no Gnome 2. Então, o que eu sugiro que você use é o gala
gerenciador de janelas, que possui um recurso "similar" e é leve. É desenvolvido pela equipe elementar, você pode instalá-lo usando o PPA:
sudo add-apt-repository ppa:elementary-os/daily
sudo apt-get update
sudo apt-get install gala
gala --repĺace
Embora ainda esteja em desenvolvimento ativo, é realmente útil.
Outra coisa que você pode tentar é usar muffin
o gerenciador de janelas no Cinnamon que também tem um recurso parecido, tudo que você precisa fazer é instalar o Cinnamon e executar muffin --replace
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