Munin é uma ferramenta de coletor de dados e visualizador (grapher). É fácil montar. Fácil de usar, mas usa recursos demais e não se adapta bem. O intervalo de coleta padrão é de 5min e não é fácil mudar isso, porque sobrecarregará sua máquina e algum plugin terá problemas se você fizer isso de qualquer maneira. Os plugins são executados ( forked ) toda vez que ocorre uma coleta de dados que é cara. Tem configuração em rede. Você tem que configurar um servidor local e um nó, mesmo se você usar uma máquina.
O Collectd é apenas uma ferramenta de coleta de dados. Você pode escolher as entidades de terceiros para representar graficamente os dados coletados, mas isso não funciona imediatamente. Tem muitos plugins, principalmente escritos como um módulo C que é iniciado uma vez quando você inicia o daemon. Você pode alterar o intervalo de coleta e obter estatísticas refinadas. Pode coletar dados localmente ou através da rede.