Você pode criar um script de shell simples para pegar a cor e copiar a saída para a área de transferência e usá-la no arquivo da área de trabalho
Aqui está o script de shell.
Eu o nomeei como grab.sh
#!/bin/bash
OUT='grabc'
echo ${OUT} | xclip -sel clip
Altere seu conteúdo do .desktop
[Desktop Entry]
Type=Application
Name=Grab Color
Exec= sh /home/user/grab.sh
Categories=Development;
Icon=/home/diogo/.local/share/applications/colorline.png
Isto irá copiar a saída para a área de transferência. Você precisa ter o xclip instalado. Se não estiver instalado. Instale-o usando o comando.
sudo apt-get install xclip