Não sei se há algo em coreutils
que possa fazer isso, mas parece que sua pergunta foi feita antes por pessoas que não estão necessariamente interessadas em uma ferramenta existente como você parece ser. Os links a seguir podem ser interessantes para você como último recurso, caso você não consiga encontrar uma ferramenta que já faz isso.
- Transpor um arquivo no Bash (do Stack Overflow)
- Transpondo linhas e colunas (deste site)
Por que vale a pena, você pode querer dar uma olhada no manual GNU coreutils , especialmente a seção 4 th