Como você apontou, muitas mudanças significativas foram introduzidas na organização do linux nos últimos anos, sendo o fim dos scripts init e alguns dos principais. Como já apontamos, blogs, fóruns e até mesmo livros provavelmente não são tão atualizados quanto você esperaria. Nesses casos, costumo me referir ao Archwiki, pois os pacotes no Arch são quase livres de patches específicos de distribuição. Algumas informações interessantes sobre como configurar a máquina para o uso diário podem ser encontradas aqui . Um bom lugar para encontrar informações precisas e rápidas é irc Freenode , especificamente #linux, um lugar onde você pode encontrar suporte para a maioria dos problemas que você estará enfrentando em um desktop linux moder.