Eu tive problema semelhante. Na verdade, eu não poderia nem mudar meus atalhos do Gerenciador de janelas - > Teclado. As configurações não foram salvas depois que fechei o Gerenciador de Janelas. Minha solução foi remover (ou simplesmente mover) as configurações de atalho do Linux Mint:
mv /usr/share/mint-configuration-xfce/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/xfce4-keyboard-shortcuts.xml{,.BAK}
e trabalhe apenas com as configurações de atalho de teclado padrão do XFCE:
/etc/xdg/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/xfce4-keyboard-shortcuts.xml
/home/user/.config/xfce4/xfconf/xfce-perchannel-xml/xfce4-keyboard-shortcuts.xml
Observação: você deve efetuar logout para que as alterações de ordem entrem em vigor.