Eu não sei sobre revistas, mas publiquei meu aplicativo através do serviço MyApps. Eles irão empacotar sua revista, então você não precisa fornecer o pacote debian. Eu deveria dar uma olhada no site para desenvolvedores do Ubuntu .
Após instalar a Revista Full Circle # 53 e lançar seu ícone do painel, o Nautilus abriu em /opt/fullcircle/issues e continha fullcircle-issue53-eng.pdf .
O que sei com certeza é que sua revista deve estar em /opt .