Sim, você pode. Isto é explicado muito bem em o ext4-wiki em kernel.org . Basicamente tudo se resume a
tune2fs -O extents,uninit_bg,dir_index /dev/DEV
e2fsck -fDC0 /dev/DEV
com / dev / DEV substituído pela partição em questão. Embora isso não seja destrutivo, sugiro que você faça um backup dos seus dados antes de fazê-lo.