Se o arquivo ISO é o mesmo usado para gravar o CD, aqui estão os meus dois favoritos:
diff /dev/sr0 /tmp/file.iso
Compara a imagem gravada com o arquivo de imagem. Se você se sentir um pouco mais masoquista, poderia tentar algo assim:
sha1sum /dev/sr0 /tmp/file.iso
e compare as assinaturas. Este é mais útil se você já tiver a soma SHA1 em algum lugar. Ambos os comandos lerão o meio até o fim.
Se você quiser fazer do jeito que o @ Marki555 sugere, você vai querer montar a unidade óptica e a imagem primeiro. Aqui está um script completo: (você pode, é claro, dispensar o sudo
se você for root - uma idéia ruim, em geral)
sudo mkdir /tmp/{a,b}
sudo mount /dev/sr0 /tmp/a -o ro # or whatever
sudo mount /tmp/file.iso /tmp/b -o loop,ro
diff -dur /tmp/{a,b}
sudo umount /tmp/a
sudo umount /tmp/b
sudo rmdir /tmp/{a,b}