Não sei por que o Nautilus não está exibindo as unidades. Parece que eles estão aparecendo como sdb , então você pode tentar forçar a montagem das partições usando sdb1 , sdb2 , etc. Assumindo você está montando a primeira partição, primeiro faça uma pasta em algum lugar (eu vou usar / mnt / sdb1 para este exemplo), então corra:
sudo mount /dev/sdb1 /mnt/sdb1
Em seguida, grave em / mnt / sdb1 e veja se os arquivos estão aparecendo. Qualquer erro que você receber ajudará você a diagnosticar o problema real. Eu normalmente acho que o sistema de arquivos pode estar corrompido, mas é improvável que seja verdade para duas unidades separadas.