Xorg --configure
enquanto o X não está rodando fez isso por mim - Eu estou no debian Sid (instável).
Você NÃO deve ter o X em execução quando fizer isso e deve estar em um console TTY. (ctrl-alt-f1 / f2 / f3 / f4 / f5 / f6)
Se o Xorg.conf não mudar depois de fazer isto, e o programa não retornou um erro, mas imprimiu um arquivo de configuração do Xorg.conf na tela, execute Xorg --configure > /etc/xorg.conf
para enviar a saída para o arquivo.
Mas a maneira que eu consegui os drivers nvidia oficiais trabalhando no final foi desinstalar a versão do gerenciador de pacotes e baixar o programa de instalação do site da Nvidia. Tem funcionado perfeitamente desde então. A única vez que não funcionou (quando eu estava tentando executar o minecraft), eu configurei a variável LD_PRELOAD=/usr/lib/libGL.so.1
e ela foi executada - o lwjgl tem problemas para detectar a versão correta da libGL a ser usada.