Parece que você escolheu ' Importar no local ' quando adicionou as fotos. Para referência futura, você deseja escolher ' Copiar fotos '.
Se essa suposição estiver correta, você terá a chance de recuperar os arquivos, desde que não tenha continuado a usar o cartão de memória. Existem várias duplicatas desta questão, você está enfrentando um simples problema de 'recuperar arquivos excluídos' já respondido aqui . Eu usei testdisk
seguindo o como-a da resposta e é muito fácil. Eu recuperei todos os arquivos sem problemas. O TestDisk está no Centro de Software, você não precisa baixá-lo de um site de terceiros.
A única outra coisa a verificar é onde você tem Shotwell configurado para importar. Na chance remota que você importou corretamente, mas depois desconectou a unidade de destino, verifique as preferências da Shotwell em Edit -> Preferences -> Library (tab) -> Library Location -> Import photos to:
e certifique-se de que ela esteja definida como o diretório Imagens ou algum outro local que esteja montado. Se você fez uma instalação normal do Ubuntu em um único disco rígido (esta é a configuração mais comum), então você pode ignorar este parágrafo inteiro e apenas clicar no link para a resposta do TestDisk no parágrafo acima. Boa sorte!