Posso pensar em algumas maneiras de lidar com isso.
O primeiro é usar Mtools para copiar os arquivos. Para que isso funcionasse, você precisaria definir "drives" (digamos A: para a unidade de origem, B: para o destino), então você deve ser capaz de copiar tudo, preservando atributos e carimbos de tempo, usando
mcopy -s -p -m a: b:
(não testado).
O segundo é pós-processar os atributos usando fatattr
(que está disponível na maioria das distribuições). Ele lida com sistemas de arquivos montados, portanto, você copiaria seus sistemas de arquivos da mesma forma que atualmente, use fatattr
para listar todos os atributos FAT de todos os arquivos de origem e analise isso para instruir fatattr
a definir atributos apropriadamente nos arquivos de destino.