Seu CPU tem dois núcleos e quatro threads, então ver identificadores duplicados é perfeitamente normal: cada “processador” listado em /proc/cpuinfo
é um processador lógico, em um núcleo físico, então você acaba com dois núcleos físicos (ids 0 e 2), com quatro processadores (ids 0, 1, 2 e 3).
A numeração do núcleo parece estranha, mas isso depende do seu firmware. O kernel calcula os principais identificadores baseado no ID do APIC , que é atribuído pelo firmware e, no seu caso, os IDs são 0, 1, 4 e 5, o que resulta em IDs principais de 0 e 2.