Com o GNU sed:
sed -i -e 's/^/ /' <file>
irá substituir o início de cada linha com 5 espaços. O -i
modifica o arquivo no lugar, -e
fornece algum código para sed
executar. s
informa sed
para fazer uma substituição, ^
corresponde ao início da linha, então a parte entre os segundos dois caracteres /
é o que irá substituir a parte correspondida no começo, isto é, o início da linha neste exemplo.