Para visualização em árvore:
Usando os menus
Ir para a vista - > Barra lateral - > Árvore
Usando a linha de comando
gsettings set org.gnome.nautilus.window-state side-pane-view "tree"
Este método definiria como padrão.
Para abrir um diretório em uma nova janela do nautilus:
Clique duas vezes no diretório que contém Shift .
Para abrir uma nova instância do nautilus
Clique com o botão direito do mouse no ícone do iniciador para nautilyus e clique em Abrir uma nova janela .