Obviamente, tune2fs
apenas configura o sistema de arquivos, ele não reescreve dados no disco. E, obviamente, sem reescrever você não obtém os mesmos resultados. Os recursos do ext4 são aplicados apenas a novos dados. Assim, se você realmente quer todos os benefícios, então você tem que fazer backup dos dados, formatar o volume como ext4 (ou fazer as alterações com tune2fs
e, em seguida, excluir todos os dados) e restaurar os dados.
Uma abordagem menos radical é ter a abordagem tune2fs
e copiar um diretório (árvore) por vez, como o espaço livre no volume permite.