Bem, isso depende dos comandos que você precisa executar:
Se você precisar executar comandos em uma sessão de tela existente, será necessário anexar novamente e executar os comandos usando esta linha de comando:
screen -r -S "<screenName>" "command/or/script/to/execute"
Se quiser executar os comandos dentro de uma nova sessão de tela, você pode usar isto:
screen -A -m -d -S "<screenName>" "command/or/script/to/execute"
Você pode ler mais sobre alguns comandos de tela comuns aqui: 10 exemplos de comando de tela para Gerenciar terminais Linux