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Este é, na verdade, destinado a filtrar o thread citado abaixo do mail (TOFU acronyme clash), mas também tem algumas opções pgp. Pode ser ativado colocando algo como %código% em seu .muttrc (não se esqueça de instalar o t-prot em primeiro lugar)
Infelizmente, isso não remove o terrível desfile de blocos de aviso que você mencionou, mas é o melhor que consegui encontrar.
Claro, você também pode filtrar seu próprio script.
Editar: Desde que eu tive o mesmo problema e ficando gawk ou semelhante para fazer o trabalho era ... eu escrevi meu próprio roteiro. Sinta-se à vontade para usar isso como o filtro de exibição: link