Você não pode; O APT usa um bloqueio para garantir que uma única operação de gerenciamento de pacotes esteja em andamento a qualquer momento. Isso é feito para reforçar a consistência: é importante manter o estado do banco de dados de pacotes e o estado dos pacotes, coerente, e a maneira mais fácil de fazer isso é garantir que eles nunca passem por várias modificações concorrentes.