Isto não é um bug, é um "recurso"!
Kate lembra a última exibição que você abriu quando salvou um documento e tentou restaurá-lo como estava.
Para reverter esse efeito, você precisa fechar as exibições atuais usando o Visualizar > Vista dividida > Fechar o menu Visualização atual e, em seguida, usar as Sessões > Opção Salvar sessão .
Depois de ter feito isso, o Kate abrirá com a sessão que você deixou.